Ředitel - Mgr. Jan Čuřín
- Bezpečnostní ředitel - Ing. Jaromír Kadlec, CSc.
- Oddělení opravných prostředků - vedoucí oddělení Mgr. Lenka Zahradnická
- Interní audit
- Sekretariát ředitele úřadu - Eva Kalabisová
Sekce bezpečnostního řízení - 1. náměstek ředitele Mgr. Jan Bechyně
- Kancelář 1. náměstka ředitele - vedoucí kanceláře Ing. Iva Pačesová
- Odbor průmyslové bezpečnosti - ředitel odboru Mgr. Jan Jandásek
- Odbor evidenčního šetření a podpory - ředitel odboru Mgr. Martin Vála
- 1. odbor personální bezpečnosti - ředitel odboru Mgr. Pavel Hubka
- 2. odbor personální bezpečnosti - ředitel odboru Mgr. Aleš Hudec
- 3. odbor personální bezpečnosti - ředitel odboru Ing. Martin Čvančara
- 4. odbor personální bezpečnosti - ředitel odboru Mgr. Radek Heran
Sekce kancelář ředitele Úřadu - náměstek ředitele Ing. Jaromír Kadlec, CSc.
- Odbor personální - ředitelka odboru Mgr. Dagmar Urbancová
- Odbor bezpečnostní - ředitel odboru Mgr. Viktor Šelmeci
- Odbor administrativní a fyzické bezpečnosti - ředitelka odboru Ing. Markéta Blatská
- Oddělení mezinárodní spolupráce - vedoucí oddělení Mgr. Zuzana Veselá
- Archiv Národního bezpečnostního úřadu
Sekce provozně právní – náměstkyně ředitele Ing. Monika Zahálková
- Odbor provozně ekonomický - ředitelka odboru Ing. Helena Lachoutová
- Odbor právní a legislativní - ředitel odboru Mgr. Jiří Malý
- Odbor komunikačních a informačních systémů - ředitelka odboru Ing. Michala Kučerová
- Oddělení kontroly - vedoucí oddělení Mgr. Pavel Kunc
